Zatwierdzenie przez Radę Ministrów Narodowych Strategicznych Ram Odniesienia na lata 2007-2013 (NSRO) 29 listopada 2006 r. oraz programów operacyjnych (listopad 2006 r. – marzec 2007 r.) zakończyło proces ustalania kształtu dokumentów programowych po stronie polskiej. Umożliwiło to rozpoczęcie oficjalnych uzgodnień z Komisją Europejską zaproponowanych przez Polskę dokumentów.
14 marca 2007 r. odbyło się jedyne oficjalne spotkanie negocjacyjne z Komisją Europejską dotyczące NSRO. Po uzgodnieniu dodatkowych uwag przekazanych przez KE w stosunku do poprawionej wersji NSRO, dokument został ponownie oficjalnie przekazany KE, która 7 maja 2007 r. wydała decyzję zatwierdzającą najważniejsze elementy NSRO. Tym samym Polska znalazła się w pierwszej dziesiątce krajów członkowskich (7 miejsce razem z Cyprem, Hiszpanią i Węgrami), których NSRO zostały wynegocjowane i przyjęte przez Komisję Europejską.
Negocjacje programów operacyjnych prowadzone były od marca do września 2007 r., zgodnie z ustalonym z KE kalendarzem negocjacyjnym, który zakładał przeprowadzenie negocjacji wszystkich programów w dwóch turach, przy ograniczeniu, z uwagi na wielość programów, liczby oficjalnych spotkań negocjacyjnych do minimum i przenosząc dyskusję na poziom roboczych spotkań z przedstawicielami Komisji Europejskiej, co znacznie przyśpieszyło wyjaśnienie i rozwiązanie wielu problemów szczegółowych wskazanych w uwagach KE.
Po konsultacjach wewnątrz KE, programy operacyjne zostały kolejny raz poprawione i wprowadzone do systemu informatycznego, jako oficjalne propozycje strony polskiej i oczekiwały na uzyskanie decyzji zatwierdzającej. Pierwszą taką decyzję uzyskał 25 lipca 2007 r. Program Operacyjny Pomoc Techniczna. Polska tym samym znalazła się w wąskim gronie nowych państw członkowskich (wraz z Maltą i Rumunią), które uzyskały pierwsze decyzje akceptujące ich programy operacyjne. Jako ostatnie, decyzje dla programów operacyjnych zostały wydane: 7 grudnia 2007 r. - dla Programu Infrastruktura i Środowisko oraz 19 grudnia 2007 r. dla Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Świętokrzyskiego.
Na stronie internetowej DG REGIO w zakładce: Zestawienie okresu programowania 2007-2013 znajdują się aktualne informacje na temat negocjacji dokumentów programowych we wszystkich państwach członkowskich.
Zobacz więcej:
Podsumowanie negocjacji z Komisją Europejską 
Raport z przebiegu procesu negocjacji z Komisją Europejską dokumentów programowych w ramach Narodowej Strategii Spójności (NSRO) 
Poniżej prezentujemy relacje ze spotkań negocjacyjnych dotyczących NSRO oraz programów w ramach NSRO z Komisją Europejską:
Narodowe Strategiczne Ramy Odniesienia 2007-2013
Program Operacyjny Infrastruktura i Środowisko
Program Operacyjny Kapitał Ludzki
Program Operacyjny Innowacyjna Gospodarka
Program Operacyjny Rozwój Polski Wschodniej
Program Operacyjny Pomoc Techniczna
Europejska Współpraca Terytorialna
6 listopada 2008 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Współpracy Transgranicznej Polska – Białoruś – Ukraina 2007-2013 
28 marca 2008 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Współpracy Transgranicznej Polska (Województwo Zachodniopomorskie) – Meklemburgia Pomorze Przednie / Brandenburgia 2007-2013 
25 marca 2008 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Współpracy Transgranicznej Polska (Województwo Lubuskie) – Brandenburgia 2007-2013 
21 grudnia 2007 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Współpracy Transnardowej Region Morza Bałtyckiego 2007-2013 (Baltic Sea Region) 
21 grudnia 2007 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Operacyjny Współpracy Transgranicznej Polska – Saksonia 2007-2013 
20 grudnia 2007 r. Program Współpracy Transgranicznej Polska - Litwa 2007-2013 został zatwierdzony przez Komisję Europejską 
20 grudnia 2007 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Operacyjny Współpracy Transgranicznej Południowy Bałtyk 2007-2013 
20 grudnia 2007 r. Program Współpracy Transgranicznej Rzeczpospolita Polska - Republika Słowacka został zatwierdzony przez Komisję Europejską 
11 grudnia 2007 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Operacyjny Współpracy Transgranicznej Republika Czeska – Rzeczpospolita Polska 2007-2013 
3 grudnia 2007 r. został zatwierdzony przez Komisję Europejską Program Współpracy Transnarodowej dla Europy Środkowej 
11 września 2007 r. został zatwierdzony przez Komisję Europejską Program Współpracy Międzyregionalnej INTERREG IV C 
30 lipca 2007 r. do Komisji Europejskiej został przesłany Program Współpracy Transgranicznej Meklemburgia/Pomorze Przednie-Brandenburgia-Rzeczpospolita Polska (Województwo Zachodniopomorskie) 2007-2013 
24 lipca 2007 r. do Komisji Europejskiej przesłane zostały następujące projekty programów:
-
Programu Współpracy Transgranicznej Rzeczpospolita Polska – Brandenburgia
-
Programu Współpracy Transgranicznej Południowy Bałtyk
-
Programu Współpracy Transgranicznej Rzeczpospolita Polska - Republika Słowacka
Europejski Instrument Sąsiedztwa i Partnerstwa
17 grudnia 2008 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Współpracy Transgranicznej Polska - Litwa - Federacja Rosyjska 2007-2013
6 listopada 2008 r. Komisja Europejska zatwierdziła Program Współpracy Transgranicznej Polska – Białoruś – Ukraina 2007-2013
Regionalne Programy Operacyjne
19 grudnia 2007 r. komisarz ds. polityki regionalnej Danuta Hübner podpisała decyzję w sprawie przyjęcia do realizacji Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Świętokrzyskiego. Tym samym mamy zatwierdzone wszystkie programy operacyjne na lata 2007-2013.
11 października 2007 r. podczas Europejskiego Tygodnia Regionów i Miast w Brukseli Komisja Europejska oficjalnie zatwierdziła kolejnych 5 programów operacyjnych dla województw: kujawsko-pomorskiego, mazowieckiego, podlaskiego, warmińsko-mazurskiego i zachodniopomorskiego
2 października 2007 r. komisarz ds. polityki regionalnej Danuta Hübner podpisała decyzję Komisji Europejskiej przyjmującą do realizacji pięć regionalnych programów operacyjnych dla województw: lubelskiego, lubuskiego, łódzkiego, opolskiego i podkarpackiego
6 września 2007 r. w Krynicy komisarz ds. polityki regionalnej Danuta Hübner, minister rozwoju regionalnego Grażyna Gęsicka oraz przedstawiciele pięciu zarządów województw: dolnośląskiego, małopolskiego, pomorskiego, śląskiego i wielkopolskiego podpisali postanowienia Komisji Europejskiej o akceptacji Regionalnych Programów Operacyjnych
Druga tura negocjacyjna
Pierwsza tura negocjacyjna
Regiony na półmetku negocjacji z KE 